当时的朱温正在东渭桥屯驻，而诸葛爽带着大军还在栎阳，于是黄巢就让朱温去说服诸葛爽投降。这一次事件，也是大多数史书中第一次记录朱温的一件史实。朱温出马，那肯定是马到成功，诸葛爽爽爽利利的投降了。

而就在黄巢登基大封群臣的时候，凤翔节度使郑畋则召集各道兵马。还有留在关中的禁军准备讨伐黄巢。

十二月十八日，唐僖宗到了兴元，向天下诸道发布诏令，命令诸路军队收复长安。

中和元年881年二月，黄巢任命朱温为东南面行营都虞候进攻邓州，想要加强长安东面的守备力量。

三月初三，顺利攻下邓州，此时朱温一路凯歌。但是另一方面黄巢准备进攻凤翔的五万大军，却遭到了惨败，被凤翔节度使郑畋在龙尾坡击败，伏尸两万，损失惨重。

三月中旬，郑畋趁热打铁传令天下，号召合军攻打黄巢，一时间天下各道军队纷纷响应。黄巢也是个聪明人，他知道进攻西面的时机已经失去了。此时要是调拨大军进攻长安西面，那么长安的相对空虚，就可能给其他的勤王军队提供一个机会。

就算是黄巢全力进攻，但是士气不高，能不能拿下凤翔还不确定的。而如果打凤翔，长安就有丢掉的风险，这是黄巢无论如何不能接受的。权衡利弊，黄巢决定收缩兵力不再进攻长安以西的地方，进行适度的战略收缩。

此后，战事发展对于黄巢越来越不利。四月初五，黄巢决定撤出长安，之后唐军大规模进入，正式接管长安。但是长安的百姓没想到，刚刚赶走了一只老虎，却迎来了一大群狼。这些唐军到了长安，和黄巢的军队没有什么两样，一样的烧杀抢掠。

而此时黄巢的大军在霸上，距离长安不过二十五里。夜里探子传来消息，听说长安城乱了，他知道他的机会来了。二话不说，带着大军又回来了，此时那些唐军哪里还有战斗力（都忙着杀人放火、抢劫敛财），被黄巢打的那是落花流水春去也！（黄巢这一次放弃长安，有人说这是战略性抉择。这件事和后来黄巢杀个回马枪，都是提前谋划好的，唐军是中计了。而且我们通过看整件事情的发展，的确是有这个可能。但这类不同观点，我觉的简单介绍一下就可以了，感兴趣的可以继续深入发掘）。

甚至还有些唐军抢的东西太多了，跑不动！被黄巢的大军抓住然后杀掉。就这样，像是一出闹剧一般，黄巢重新掌握了长安，然后疯狂纵兵屠虐。报复唐军和长安的百姓。

此后各路军队一看得不到什么好处，纷纷返回。黄巢声势更为强大，而就在之前黄巢放弃长安的事件中，朱温也用行动支持黄巢。

当时朱温占据邓州，而黄巢任命的同州刺史、华州刺史、商州刺史听说黄巢弃城而逃，竟然也弃城而逃，投奔朱温，朱温一看，根本不给他们辩解的机会。一个擅离职守图谋背叛大齐的罪名就将这三人抓了起来。

恰好此时黄巢回到长安的消息传来，朱温干净利落的杀死了同州刺史、华州刺史。因为之前朱温路过商州的时候，商州刺史接待他非常好，两人之间总归是有点感情。所以朱温就放了商州刺史，继续让他带着他的军队回到商州小心防守。

后来他对黄巢报告的时候，对商州刺史进行了开脱，最终免于一死。由此可见，朱温也并不是一味的凶狠残暴。要是没点特点，没点能力和情商，想在唐末混下去，是十分不容易的。

六月份朱温回到了长安。虽然这一次朱温是败退回来的（杨复光联合几个藩镇攻克邓州，赶跑了朱温）。但就算是这样黄巢还是亲自到灞上迎接朱温，给予了非常高的礼遇。此时的朱温已经成为了黄巢手下的大将，同时也是黄巢的爱将。当然这和当时黄巢的情况是分不开的。

当时黄巢被各路勤王大军步步紧逼，形势已经相当的严峻了，此时朱温的归来，不仅仅是他一个人回来，而是一支久经沙场的生力军，虽然这只军队人数非常少，而且刚刚打了败仗，但是还是有战斗力的。俗话说千军易得一将难求，对于义军来说能活下来的老兵也是好宝贝。自然要好好的笼络一番。所以亲自出城迎接朱温也就不足为奇了。

当年七月，朱温就接到了任务。当时唐延节度使和权夏州节度使，两人合兵驻扎在东渭桥围困长安，所以黄巢便让朱温带领本部人马把他们赶走。